Система для проведения цифровой количественной амплификации нуклеиновых кислот в комплекте QX200 AutoDG Droplet Digital PCR System

Система для проведения цифровой количественной амплификации нуклеиновых кислот в комплекте QX200 AutoDG Droplet Digital PCR System (2016, Bio-rad Laboratories, США) — система цифровой капельной ПЦР с автоматической пробоподготовкой и анализом результатов в программе QuantaSoft. Цифровая капельная ПЦР представляет собой третье поколение технологии ПЦР. В отличие от реал-тайм ПЦР, хорошо известного количественного относительного метода, цифровая ПЦР является абсолютным, менее чувствительным к влиянию ингибиторов, методом измерения. Система ddPCR определяет абсолютное количество молекул нуклеиновых кислот, инкапсулированных в дискретные капли водно-масляной эмульсии  волюмометрическим методом. Концентрация ДНК-мишени определяется в исходном образце в виде числа копий в микролитре с чувствительностью до 1 молекулы. Метод имеет высокую воспроизводимость  результатов в широком спектре концентраций. Данное оборудование необходимо для высокоточного анализа экспрессии генов (точность ±10%;); детектирования изменения числа соматических копий гена (определение CNV с точностью соотношения 1.2х), что является отличительной особенностью множества видов раковых заболеваний; высокоточного определения редких мутации (чувствительность детектирования 0,001% мутантов), что позволяет производить более чувствительную и менее инвазивную диагностику; выявления наличия опухолевых клеток при очень небольшом титре; изучения клональной гетерогенности в популяциях клеток по уровню экспрессии генов-мишеней; исследование вариабельности генной экспрессии на уровне единичных клеток; проведение miRNA анализа с более высокой точностью и чувствительностью по сравнению с RT-PCR; высокоточное изучение эпигенома, в частности характер метилирования гена-мишени и модификацию хроматина на уровне единичных клеток; детекции патогенов, определения и мониторинга вирусной нагрузки; использования в области Next generation sequencing (приготовление библиотек и квантификация для высокопроизводительного секвенирования).